阳光明媚、寂静平和的海滩，一群小海龟孵化出壳，他们摆动着稚嫩的臂膀，奋力向大海爬去。名叫萨米（比利·安格 Billy Unger 配音）的小海龟最后爬出蛋壳，但是他怎么也无法爬出沙坑。焦急时分，塞米更被海鸟捉到空中，眼看就成为了对方的点心。混乱之际，他结识了美丽的女孩莎莉（伊莎贝拉·弗尔曼 Isabelle Fuhrman 配音）。此后，他乘坐轮船的碎木板像海洋中心飘去，偶然遇到了他一生的好朋友雷。　　在此后的50年里，两个小家伙乘坐破木板周游世界，见识了海洋各处的美景奇观，也经历着人类为了私欲对海洋做出

自2002年X档案的六年后，前联邦探员丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）调任某教会医院担任医师，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）则过着隐居的生活，继续着对超自然现象的关注。某天，FBI探员前来请求他们的帮助。原来一段时间内，维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪，其中甚至包括一名联邦探员。由于神父约瑟夫（Billy Connolly 饰）声称看到了犯罪画面，因此FBI希望对超自然案件有着丰富经验的穆德和斯科莉协助调查。然而随着调查的深入，穆德和斯科莉