韩国反恐局最优秀特工李正宇偶遇情报局展厅向导尹惠仁，被其深深吸引，无奈屡屡示好均被冰山美人果断拒绝，不解之余渐渐感觉到惠仁身上似乎有别样身世迫其努力与他人保持距离。时值韩国自主研发最新核反应堆关键时刻，而这一消息对名为“雅典娜”的组织而言则如惊天霹雳，此秘密存在的组织一直掌控着全球能源市场，为保住其统治地位，不惜发动恐怖袭击甚至挑起战争。此次韩国成了他们的眼中钉，为达目的，组织动用了其核心成员，安插在美国情报局东亚分部的部长孙赫利用职务之便，不惜一切阻止韩国的研发进程，必要再掀一番血雨腥风。

影片改编自同名电视剧。《秘密特工》是1964年到1968年间的一部经典电视剧，共播出了105集，由老牌影星罗伯特·沃恩 、大卫·麦考姆联袂主演，是当年一部著名的双雄剧。故事内容是关于“执法联合指挥部”的两名特工对抗敌方组织T.H.R.U.S.H.（Technological Hierarchy for the Removal of Undesirables and the Subjugation of Humanity）的故事。这个间谍二人组比当时的007还要显眼，剧集中各种先进的枪支、间谍工具层出不穷，